回复“ 培训 ”，马上报名第四期生信培训营（9.23~25）！ 相信很多小伙伴们都和小编一样，看到厚厚的R语言教程直接懵逼了，内心的OS一定是这样的：我又不是程序猿，我也不想学辣么复杂的R语言，我只想画个散点图而已
但是小编觉得Excel做出来的图真的好丑，怎么办？（当然你也可以来联川生物报名 第四期生信营 ，会有大神级的Excel高级作图秘籍传授哦！） 在作图前，大家要明白散点图是什么，我们为什么要做散点图
散点图是用来评价测序的 两个样本或者两组数据之间的差异性和一致性 （敲黑板，划重点）
Origin作为一款强大的作图软件和统计软件，目前在学术界和工业界广为推崇
很多撰写硕士论文、博士论文乃至SCI论文的科研工作者，都喜欢使用Origin作图
由于界面友好、操作简便，许多不会使用R语言编程的小伙伴都会首推Origin作图
那么这款软件为何那么受大家喜欢呢？ 首先Origin是Origin Lab公司出品的较流行的专业函数绘图软件，是公认的简单易学、操作灵活、功能强大的软件，既可以满足一般用户的制图需要，也可以满足高级用户数据分析、函数拟合的需要
自1991年问世以来，Origin以其操作简便，功能开放，很快成为国际流行的分析软件之一，获得了广泛的认可与应用
小编觉得Origin受欢迎的理由无非是以下几点： 1、不会编程也能立即使用，上手极其简单
相比之下R语言或Matlab多少需要一些编程技巧，入门不太友好
2、输出图片为矢量图形，可以无限放大，尤其适合SCI论文的原始配图
3、存在多种作图模板，非常适合新手
绘图之前选择合适的模板即可
4、可以和各种数据库软件、办公软件、图像处理软件兼容
………… 关于图像处理软件兼容问题，小编今后会出个高级教程教大家使用，也欢迎大家报名联川生物的生信营，小编会亲自教大家一些你们所不知道的Origin冷门技巧
所以大家想要使用Origin做出美美的统计图，需要给自己定一个小小的目标： 可是现实是残酷的，往往开始大家的做图效果都不甚理想，理想中的散点图是这样的： 或者是这样的： 但是实际上自己的散点图却是这样的： 别急，小编接下来带你一步步做出自己想要的散点图
第一步：安装Origin软件，小编使用的是Origin8.5
安装完了之后会出现Origin的登录界面
如下图所示: 第二步 ：载入操作界面，如下图所示
a为文件的路径所在地址； b为软件的菜单栏； c和d都是Origin一些主要功能的快捷键如插入文字表格图形模板等等
第三 步： 添加列数
点击菜单栏的Column之后再按Add New Columns, 这时候软件会跳出一个对话框要求你填入增加的列数
一般数据列数较多的话建议数字可以填写的大一些，一般小编喜欢直接添加10列，是不是感觉简单粗暴呢？ 之后软件内的列数增加到了12列
第四步 ： 保存文件
Save Project可以填写自己想要的文件名，这里小编写成了Scatter_demo
注： 这里保存的不是图片文件，而是Origin特有的以opj作为文件名后缀的工程文件，里面包含数据、图片、统计信息等
第五步：输入数据
这里，小编把用于测试的demo数据从Excel直接导入进了两列中
当然大家既可以输入txt格式，也可以从Excel中把需要的数据拷贝进Origin
通过上图我们可以看到这里一共有两列数据，分别是Control1 FPKM和Control2 FPKM
从字面上就可以看出这是两个样本内所有基因各自的FPKM值
有些同学又要问了，为何我那里显示的只是B(X)和C(Y)？没关系，双击B(X)后会跳出对话框，你可以在里面修改该列的名字
如下图所示： 第六步：生成未修改的散点图 和Excel中操作的一样，先选中Control1和Control2两列，然后点击菜单栏Plot->Symbol->Scatter
之后会生成这样的图形： 别慌，让小编这位老司机带你一步步破解谜题
首先由于数据量较大，软件会进入节省模式，也就是Speed Mode is On
其目的是防止软件由于数据量过于庞大而崩溃
这里有两种应对方式，第一种对FPKM值进行处理，也就是Log10 (FPKM+1)
另外一种就是对坐标轴的递增关系改为Log10,
两种方法都是可行的
这里小编就以坐标轴Log10举例说明Origin中是如何做到的
首先双击Y轴（X轴也可以），会出现下面的对话框： 通过上图我们就可以发现，一共有7个选项分别是Tick Labels、Minor Tick Labels、Custom Tick Labels、Scale、Title & Format、Grid Lines和Break
若要修改坐标轴的跨度方式是Log10，鼠标单击Scale一栏即可，如下图所示： 我们在Type那一列将Linear改成Log10即可
之后再对显示范围即From和To的范围做个限定就可以了，这里小编选择的是0.001到1000的范围
最后效果图如下所示，是不是感觉已经有一些样子了呢？ 既然图片大致已经成型，接下来就是对散点图中的一些细节做一些调整了，比如坐标轴的刻度、计数方式、散点的大小颜色等等
第七步，散点图细节调整
坐标轴刻度，我们可以做一些工作使其显示更加美观
还是先双击坐标轴，出现下面的对话框： 如果我们不需要坐标轴的副轴刻度，可以选择Minor Ticks选项中的None，如果刻度方向想朝向X轴或Y轴内部，可选择Major Ticks和Minor Ticks选项中的In
如果想要调整坐标轴上的计数方式，可以选择在Tick Labels一栏内的Display选项中的Scientific:1E3， 调整散点大小和颜色可直接双击散点，之后会跳出下面的对话框： 在这里可以对散点的大小、形状以及颜色一一作出对应的调整，以本次图片为例
我们将散点大小Size改为2，图形选择为圆点，颜色依旧保持黑色，最后的成型图如下所示，是不是感觉有模有样了呢？ 第八步：生成矢量图形
点击菜单栏File->Export Graphs->Open Dialog，出现下列对话框： 这里小编选择了png格式，图片名为Scatter，输出路径为桌面Desktop
最后png的效果图如下： 是不是感觉so easy呢？这里的相关系数R 2 =0.894究竟是什么算出来的呢？小编暂时卖个关子，欢迎来我们生信营，我们会一一为你解答
下期小编会着重讲解论文中重中之重的柱状图
当大家做完了几十个qPCR的验证，想把这些序列的柱状图放在一个图中到底怎么办？microRNA长度分部频率统计怎么做？ 是不是很想做出下面这样的效果： 或者是这样的效果： 或者是这样的效果： 又或者是这样的效果： 没关系，基础的作图技巧统统免费告诉大家
有了这些小技巧，各位同学在撰写论文的时候将会无往不胜！如果想要了解更多的高阶技巧，欢迎参加联川生物生信营
我们只讲马上能用的分析技能，方便大家在前期处理数据以及后期撰写论文上能够节省大量的时间
最后预祝各位能够顺利毕业，paper越发越多
回复“ 礼物 ”，马上报名参加开学季送好礼活动！ 回复“ 分析技能 ”，马上获取常用数据分析技能
